C’est la bulle pontificale Super Universas (31 juillet 1559) qui crée le diocèse de Namur. Ce dernier fait partie de la province ecclésiastique de Cambrai (groupe gallo-wallon), avec ceux de Saint-Omer, Cambrai, Boulogne, Tournai et Arras. La collégiale Saint-Aubain est alors choisie comme siège du diocèse.
Remontant au XIe siècle, l’édifice, déjà inadapté, ne supporte pas les inondations de 1740 et il est décidé de la construction d’une nouvelle cathédrale. Les plans en sont confiés à un architecte italien, Gaetano Pisoni, et le chantier commence en 1751 sous la direction de Jean-Baptiste Chermanne. Conservant l’ancienne tour surélevée en 1648, la nouvelle cathédrale réunit l’église Saint Jean l’Évangéliste en une seule construction surmontée d'une coupole. Achevée en 1769 et consacrée en 1762, la cathédrale Saint-Aubain est le plus imposant édifice religieux de Wallonie. Classée en 1936, elle figure sur la liste du patrimoine exceptionnel de Wallonie.