En 1047, le comte Albert II de Namur et douze chanoines fondent le Chapitre de Namur pour la collégiale dédiée à Saint-Aubain. Frédéric d’Ardenne, ancien archidiacre de Liège, pourrait avoir été le premier doyen de ce nouveau chapitre. Il sera élu pape en 1057 sous le nom d’Étienne IX. À cette époque, l’édifice se trouve en dehors des murailles de la ville, mais sera englobé lors de la construction de la troisième enceinte, durant les XIIIe et XIVe siècles.