Soutenu par Jean Sans Peur, le duc de Bourgogne, ainsi que par Guillaume, comte de Hainaut, Jean de Bavière affronte victorieusement les milices populaires liégeoises sur le champ de bataille d’Othée, le 23 septembre 1408. Vaincues par les armes, les milices populaires font allégeance et la population liégeoise est sévèrement sanctionnée. À l’heure où Jean de Bavière rentre dans la Cité (6 octobre), la Sentence de Lille (24 octobre) supprime les institutions communales de la Cité et des Bonnes villes, tandis que de lourdes amendes sont infligées et que tous ceux qui ont tenu tête aux Bourguignons sont persécutés. Désormais, tous les pouvoirs sont dans les mains du prince qui a aussi obtenu la suppression des chartes et privilèges antérieurs. Les chartes et autres règlements sont brûlés sur la place du marché ; c’est vraisemblablement à cette occasion que disparaît l’original de la Charte de Huy de 1066 ; toutes les libertés sont abolies ; les fortifications sont démantelées.
La révolte de la Cité contre l’autoritarisme du prince a échoué. Le 26 mars 1417, la Sentence de Lille sera annulée par l’Empereur Sigismond et entrera alors en vigueur le règlement dit de Jean de Bavière. La principauté est désormais tombée sous la domination de la maison de Bourgogne et sa spécificité démocratique est entravée.